怎么打包时修改jsb_polyfill文件

我再1.4版本中遇到一个问题就是 setLocalZOrder() 用这个函数时出现一个问题!
有个参数是NaN,
俩个场景切换时出现这个我问题的!
我找了没有设置这个值的地方,我打算修改jsb_polyfill文件的
求解决

            zIndex: {
                get: function() {
                    return this._localZOrder;
                },
                set: function(value) {
                    value=(typeof(value)=='number'?value:0);

                    if (this._localZOrder !== value) {
                        this._localZOrder = value;
                        this._sgNode.zIndex = value;
                        this._parent && updateOrder(this);
                    }
                }
            },

在引擎目录下找到这段代码得js,修改后,编译一下引擎就可以了,编译方法参考文档中的 ‘自定义引擎’ 部分

jsb_polyfill.js这个文件是打包是才生产的!具体怎么生产还不太清楚!所以不听清楚怎么修改?求解决